科技成果轉化項目的認定流程一般包括：1.由項目承擔單位提交申請材料，包括科技成果證明、轉化實施方案、經濟效益預測報告等；2.由相關科技行政管理部門或指定的專業機構對申報材料進行形式審查；3.通過形式審查后，組織專家進行實地考察和技術評審；4.根據評審結果，由科技行政管理部門作出是否予以認定的決定并公示；5.公示期滿無異議的，正式頒發科技成果轉化項目認定證書。